为什么 『支付宝』、『微信』 一直不支持安卓原生指纹支付？

从主观角度猜测，我感觉可能和国内互联网巨头企业基本一直以来，比起构建开放体系而言，更愿意构建闭环生态的原因有关。

另外想了一下有可能也不排除支付宝和微信上指纹支付的规划很可能早于 Android 6.0 发布，而记得在之前的原生系统中是不提供指纹 API 的，也可以说是国内厂商在沿用对应之前系统版本的解决方案，加上国内安卓环境碎片化更加严重（例如很多国产厂商的机器到现在最新系统版本还在使用 Android 4.4，在国际厂商中部分较老的设备也是这样）才导致这种决定。

很抱歉可能这个答案并没回答问题。我基本上也很少使用真正的原生系统（不常用 Google 服务，另外在我个人认知中 AOSP，Nexus/Pixel 官方系统，CM等是有区别的），那么接下来就按照我目前使用的设备和极为有限的认知描述下情况吧。

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按我个人所知，目前三星国行官方系统可以支持支付宝指纹支付，但据说刷为港行官方系统后失效（同时无法在国内使用 Samsung Pay）。

此外如果尝试 Root 将会触发三星自带的 Knox 安全机制，相关模块状态会被更改且几乎永久性无法恢复，这时支付宝指纹支付选项似乎也会消失（同时 Samsung Pay 以及 My KNOX 双开功能永久失效，对于国行设备而言额外还有一条等于放弃保修），据说小米魅族一类的国产机 Root 以后也无法使用指纹支付，估计是出于涉及金钱交易增加的安全机制。

Samsung Pay 服务可以和原生自带的 Android Pay 并存，根据网上消息在原生系统中，国内用户使用部分银行的 HCE 云闪付客户端也能在 Android Pay 选项中看到。与支付宝相关的地方好像就是国行系统除了预装了可卸载的支付宝客户端，好像还有一个安全校验服务在系统中，而后者根据某些描述和指纹有关联。

利益相关：Galaxy S7 edge 用户，国行官方 6.0.1，未 root，KNOX 0x0（可正常使用关联的所有服务并保修）